Филиал АО «Институт Гидропроект» в Республике Таджикистан осуществляет координацию работ оперативного проектирования в Республике Таджикистан Группами рабочего проектирования и авторского надзора за строительством, выполняет административно-хозяйственные функции.
В настоящее время основной деятельностью филиала является надзор за строительством Рогунской ГЭС, крупнейшей гидроэлектростанции в Республике Таджикистан.
Планируется участие филиала в проектных работах, авторскому и техническому надзору по реконструкции Нурекской ГЭС, Кайракумской ГЭС, Головной ГЭС, а также участие в других проектных работах на строительных объектах, которые будут возводиться в Республике Таджикистан.